L'imperatore Massimiliano II acquistò il terreno nel 1569 come riserva di caccia, aggiungendo in seguito un modesto palazzo. Il suo nome, "Schönbrunn" o "bella sorgente", deriva da una fonte d'acqua scoperta nel 1612. L'assedio ottomano del 1683 distrusse gran parte della tenuta, aprendo la strada a progetti più grandiosi.