Lorsque Sigmund Freud s'est installé dans le nouveau bâtiment en 1891, le bâtiment précédent, qui appartenait à Victor Adler, a été démoli. Le bâtiment, où Freud a vécu et écrit pendant 47 ans, abrite désormais un centre documentaire présentant sa vie et son œuvre.
Le musée englobe l'ancien cabinet et les locaux privés de Freud, qui sont rattachés à la plus grande bibliothèque de recherche psychanalytique d'Europe, contenant 35 000 volumes, et à l'institut de recherche de la Fondation Sigmund Freud. L'exposition comprend des objets originaux ayant appartenu à Freud, sa salle d'attente et des pièces de sa collection d'antiquités. Bien que le célèbre canapé de Freud et la plupart des meubles d'origine se trouvent au Freud Museum de Londres, un troisième musée a été ouvert au public en 2006 dans la ville tchèque de Příbor, dans la maison où Freud est né.